خدمات اکوسیستم شاخصی مهم برای اندازه گیری ارزش حفاظت از اکوسیستم های طبیعی هستند که به‌ عنوان شاخص‌های مرجع، نقش مهمی در تصمیم‌گیری مدیریتی مناطق حفاظت شده ایفا می‌کنند. هدف این مطالعه پاسخ به نبود بررسی جامع در رابطه با استفاده از مفهوم خدمات اکوسیستم در کارایی اکوسیستم ها است. بدین منظور مدل سازی خدمت اکوسیستمی کیفیت زیستگاه در استان خوزستان به عنوان اکوسیستم شهری و در مناطق حفاظت شده آن به عنوان اکوسیستم های طبیعی با مدل InVEST انجام شد. سپس ارزش اقتصادی کیفیت زیستگاه هر دو اکوسیستم طبیعی- انسانی با کاربرد داده های اقتصادی ملی و بین المللی و مبتنی بر روش انتقال منفعت بر اساس خروجی نقشه مدل سازی تعیین شد. بر اساس نتایج مدلسازی، مناسب ترین زیستگاه ها به دلیل بارش مطلوب، پوشش گیاهی متنوع و فاصله تا منابع تهدید در بخش هایی از شمال، شمال شرق، شرق و تکه هایی از جنوب و مرکز استان مشاهده می شود. بر اساس نتایج ارزش اقتصادی سالانه کیفیت زیستگاه و تنوع زیستی در کل استان، 62/02تریلیون ریال (6 همت) و در مناطق تحت حفاظت 6440 میلیارد ریال در سال است. نتایج به دست آمده از این مطالعه می تواند ابزاری برای مدیریت خردمندانه مناطق تحت مدیریت و بازنگری مرزهای این مناطق در آینده باشد.